- Reunir la producción científica generada hasta la fecha. Utilizarla como punto de partida para un análisis global, transversal y unitario.
- Analizar la información existente y reunir nuevos datos sobre la evolución de la línea de costa en la fachada oceánica de Cádiz, mediante un estudio microespacial extrapolable a un ámbito geográfico más amplio.
- Poner en relación las variaciones geomorfologicas de La Caleta con la ocupación antrópica del lugar; en especial con el canal Bahía-Caleta y su uso como puerto y zona de fondeo.
- Realizar una primera actuación arqueológica en los pecios ya detectados en La Caleta, mediante sondeos y excavación, para profundizar en el conocimiento de la actividad náutica de la zona.
- Abrir una línea de investigación en Arqueología Náutica y Subacuática de forma estable y con un alto componente de actuación en el mar. Se trata de la primera iniciativa de este tipo en una universidad española.
- Profundizar en el análisis del papel de Cádiz en el tráfico atlántico moderno con especial incidencia en las redes y flujos de tráfico mercantil y la evolución de sus defensas frente a otras potencias, a través del estudio cartográfico de la zona.
- Conocer la estratigrafía geológico/arqueológica para facilitar la reconstrución micro espacial de la paleotopografía de la zona.
- Promover actividades de difusión con el doble objetivo de poner a disposición de la sociedad los resultados y contribuir a concienciar sobre la necesidad de proteger el patrimonio cultural subacuático.
- Proponer medidas de conservación in situ para los materiales de los yacimientos arqueológicos que se estudien, en función de su naturaleza, tal y como recomienda la UNESCO.